Protein–RNA interactions for Protein: Q11136

Pepd, Xaa-Pro dipeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PepdQ11136 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PepdQ11136 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PepdQ11136 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PepdQ11136 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PepdQ11136 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PepdQ11136 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PepdQ11136 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PepdQ11136 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PepdQ11136 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PepdQ11136 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PepdQ11136 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PepdQ11136 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PepdQ11136 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PepdQ11136 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PepdQ11136 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PepdQ11136 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PepdQ11136 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PepdQ11136 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PepdQ11136 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PepdQ11136 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PepdQ11136 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms