Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Gli2Q0VGT2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Gli2Q0VGT2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Gli2Q0VGT2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Gli2Q0VGT2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Gli2Q0VGT2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Gli2Q0VGT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Gli2Q0VGT2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Gli2Q0VGT2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Gli2Q0VGT2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms