Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGB7

Ppp4r2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r2Q0VGB7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ppp4r2Q0VGB7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ppp4r2Q0VGB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ppp4r2Q0VGB7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ppp4r2Q0VGB7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ppp4r2Q0VGB7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ppp4r2Q0VGB7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ppp4r2Q0VGB7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms