Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Shisal1Q0VBP7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Shisal1Q0VBP7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Shisal1Q0VBP7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisal1Q0VBP7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisal1Q0VBP7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms