Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cntnap5aQ0V8T9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cntnap5aQ0V8T9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cntnap5aQ0V8T9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntnap5aQ0V8T9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cntnap5aQ0V8T9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cntnap5aQ0V8T9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cntnap5aQ0V8T9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cntnap5aQ0V8T9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cntnap5aQ0V8T9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cntnap5aQ0V8T9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cntnap5aQ0V8T9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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