Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ssrp1Q08943 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ssrp1Q08943 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ssrp1Q08943 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ssrp1Q08943 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ssrp1Q08943 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ssrp1Q08943 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssrp1Q08943 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ssrp1Q08943 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms