Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MestQ07646 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MestQ07646 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MestQ07646 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MestQ07646 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MestQ07646 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MestQ07646 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MestQ07646 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MestQ07646 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MestQ07646 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MestQ07646 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MestQ07646 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MestQ07646 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MestQ07646 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MestQ07646 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MestQ07646 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MestQ07646 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MestQ07646 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MestQ07646 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MestQ07646 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MestQ07646 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MestQ07646 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MestQ07646 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MestQ07646 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MestQ07646 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MestQ07646 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MestQ07646 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MestQ07646 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MestQ07646 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MestQ07646 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MestQ07646 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MestQ07646 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MestQ07646 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MestQ07646 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MestQ07646 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MestQ07646 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MestQ07646 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MestQ07646 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MestQ07646 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MestQ07646 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MestQ07646 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MestQ07646 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MestQ07646 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MestQ07646 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MestQ07646 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MestQ07646 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MestQ07646 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MestQ07646 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MestQ07646 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MestQ07646 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MestQ07646 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MestQ07646 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MestQ07646 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MestQ07646 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MestQ07646 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MestQ07646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MestQ07646 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MestQ07646 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MestQ07646 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MestQ07646 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MestQ07646 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MestQ07646 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
MestQ07646 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MestQ07646 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MestQ07646 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MestQ07646 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MestQ07646 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MestQ07646 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MestQ07646 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MestQ07646 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MestQ07646 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MestQ07646 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MestQ07646 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MestQ07646 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MestQ07646 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MestQ07646 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MestQ07646 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MestQ07646 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms