Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NrepQ07475 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrepQ07475 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrepQ07475 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NrepQ07475 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NrepQ07475 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrepQ07475 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NrepQ07475 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NrepQ07475 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms