Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdx4Q07424 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdx4Q07424 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdx4Q07424 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdx4Q07424 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdx4Q07424 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms