Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Siah2Q06986 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Siah2Q06986 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Siah2Q06986 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Siah2Q06986 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms