Protein–RNA interactions for Protein: Q05915

Gch1, GTP cyclohydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gch1Q05915 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gch1Q05915 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gch1Q05915 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gch1Q05915 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gch1Q05915 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gch1Q05915 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gch1Q05915 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms