Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Fmn1Q05860 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Fmn1Q05860 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
Fmn1Q05860 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Fmn1Q05860 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC40.32■■■■■ 4.05
Fmn1Q05860 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
Fmn1Q05860 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.03
Fmn1Q05860 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Fmn1Q05860 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Fmn1Q05860 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Fmn1Q05860 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Fmn1Q05860 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Fmn1Q05860 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Fmn1Q05860 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC40■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Fmn1Q05860 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms