Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hspg2Q05793 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hspg2Q05793 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hspg2Q05793 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hspg2Q05793 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hspg2Q05793 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms