Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top1Q04750 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top1Q04750 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1Q04750 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top1Q04750 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1Q04750 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top1Q04750 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top1Q04750 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top1Q04750 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top1Q04750 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top1Q04750 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top1Q04750 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1Q04750 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1Q04750 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top1Q04750 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top1Q04750 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Top1Q04750 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Top1Q04750 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms