Protein–RNA interactions for Protein: Q04116

YHP1, Homeobox protein YHP1, yeastyeast

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHP1Q04116 MTO1YGL236C 2010 nt6.82□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 TRP2YER090W 1524 nt6.81□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 SEN2YLR105C 1134 nt6.81□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 YOR072WYOR072W 315 nt6.81□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 YBR232CYBR232C 360 nt6.81□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 GGA2YHR108W 1758 nt6.8□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 THI6YPL214C 1623 nt6.79□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 TUB4YLR212C 1422 nt6.79□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 HBS1YKR084C 1836 nt6.79□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 SBP1YHL034C 885 nt6.79□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 NAP1YKR048C 1254 nt6.79□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 ENO2YHR174W 1314 nt6.78□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 YLR072WYLR072W 2082 nt6.78□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 PAR32YDL173W 888 nt6.78□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 MIM1YOL026C 342 nt6.78□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 DTR1YBR180W 1719 nt6.78□□□□□ -1.32
YHP1Q04116 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.77□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 AAT1YKL106W 1356 nt6.77□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 NIF3YGL221C 867 nt6.76□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 TPC1YGR096W 945 nt6.76□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 SRM1YGL097W 1449 nt6.76□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 APS2YJR058C 444 nt6.75□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 YMC2YBR104W 990 nt6.75□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 LEU2YCL018W 1095 nt6.75□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 MEX67YPL169C 1800 nt6.75□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 NAM8YHR086W 1572 nt6.74□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 AAC3YBR085W 924 nt6.74□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 SRP54YPR088C 1626 nt6.74□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 DUR3YHL016C 2208 nt6.74□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 YIL177CYIL177C 5277 nt6.73□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 KRE1YNL322C 942 nt6.73□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 EMC3YKL207W 762 nt6.72□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 REX2YLR059C 810 nt6.72□□□□□ -1.33
YHP1Q04116 YJL064WYJL064W 396 nt6.71□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 MRS4YKR052C 915 nt6.71□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 ORT1YOR130C 879 nt6.71□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 GAL2YLR081W 1725 nt6.7□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 CDD1YLR245C 429 nt6.7□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 GAS1YMR307W 1680 nt6.7□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 YMR210WYMR210W 1350 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 snR86snR86 1004 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 NAS2YIL007C 663 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 TPN1YGL186C 1740 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 URA8YJR103W 1737 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 PTC6YCR079W 1329 nt6.69□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 TMS1YDR105C 1422 nt6.68□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 PAU19YMR325W 375 nt6.68□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 PUP1YOR157C 786 nt6.68□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 IGD1YFR017C 588 nt6.67□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 FSH2YMR222C 672 nt6.67□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 FTH1YBR207W 1398 nt6.67□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 THP3YPR045C 1413 nt6.67□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 SPE2YOL052C 1191 nt6.66□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 MDL2YPL270W 2322 nt6.66□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 YPT11YNL304W 1254 nt6.65□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 LEA1YPL213W 717 nt6.65□□□□□ -1.34
YHP1Q04116 ABP1YCR088W 1779 nt6.64□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 snR4snR4 186 nt6.64□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 DUS3YLR401C 2007 nt6.63□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 GTB1YDR221W 2109 nt6.62□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 HEM14YER014W 1620 nt6.62□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 YBR056WYBR056W 1506 nt6.62□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 SDS24YBR214W 1584 nt6.61□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 VBA3YCL069W 1377 nt6.6□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 HIS3YOR202W 663 nt6.6□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 DIA4YHR011W 1341 nt6.59□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 IPL1YPL209C 1104 nt6.59□□□□□ -1.35
YHP1Q04116 POP2YNR052C 1302 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 FIT1YDR534C 1587 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YCR025CYCR025C 411 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 PHB2YGR231C 933 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YKR012CYKR012C 378 nt6.58□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 LYS20YDL182W 1287 nt6.57□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YJL009WYJL009W 327 nt6.57□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 SLG1YOR008C 1137 nt6.57□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 RFC1YOR217W 2586 nt6.57□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 ADE16YLR028C 1776 nt6.57□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 FLX1YIL134W 936 nt6.56□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 ADH3YMR083W 1128 nt6.56□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 MEP1YGR121C 1479 nt6.55□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 MOB1YIL106W 945 nt6.55□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YIR035CYIR035C 765 nt6.55□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 BUB2YMR055C 921 nt6.55□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YJR149WYJR149W 1215 nt6.54□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 TOK1YJL093C 2076 nt6.53□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 YFR020WYFR020W 699 nt6.53□□□□□ -1.36
YHP1Q04116 RSM7YJR113C 744 nt6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.3 ms