Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pfdn6Q03958 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pfdn6Q03958 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pfdn6Q03958 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pfdn6Q03958 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pfdn6Q03958 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pfdn6Q03958 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn6Q03958 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms