Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl7Q03366 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl7Q03366 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl7Q03366 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl7Q03366 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms