Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnnb1Q02248 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnb1Q02248 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnb1Q02248 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnnb1Q02248 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnnb1Q02248 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnnb1Q02248 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ctnnb1Q02248 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ctnnb1Q02248 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ctnnb1Q02248 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ctnnb1Q02248 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms