Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxd1Q01822 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hoxd1Q01822 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxd1Q01822 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxd1Q01822 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxd1Q01822 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxd1Q01822 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 769.6 ms