Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F8a1Q00558 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F8a1Q00558 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F8a1Q00558 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F8a1Q00558 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
F8a1Q00558 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
F8a1Q00558 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
F8a1Q00558 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms