Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stx2Q00262 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Stx2Q00262 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Stx2Q00262 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stx2Q00262 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stx2Q00262 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stx2Q00262 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms