Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmklr1P97468 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmklr1P97468 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmklr1P97468 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cmklr1P97468 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cmklr1P97468 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms