Protein–RNA interactions for Protein: P97360

Etv6, Transcription factor ETV6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv6P97360 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Etv6P97360 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Etv6P97360 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Etv6P97360 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Etv6P97360 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Etv6P97360 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Etv6P97360 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Etv6P97360 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Etv6P97360 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Etv6P97360 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Etv6P97360 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Etv6P97360 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Etv6P97360 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Etv6P97360 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Etv6P97360 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Etv6P97360 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Etv6P97360 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Etv6P97360 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Etv6P97360 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Etv6P97360 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Etv6P97360 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Etv6P97360 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Etv6P97360 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms