Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arf1P84078 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf1P84078 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Arf1P84078 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Arf1P84078 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf1P84078 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf1P84078 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf1P84078 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arf1P84078 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf1P84078 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf1P84078 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arf1P84078 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arf1P84078 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Arf1P84078 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms