Protein–RNA interactions for Protein: P83510

Tnik, Traf2 and NCK-interacting protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnikP83510 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TnikP83510 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TnikP83510 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TnikP83510 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
TnikP83510 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
TnikP83510 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
TnikP83510 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TnikP83510 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TnikP83510 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TnikP83510 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
TnikP83510 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TnikP83510 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TnikP83510 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TnikP83510 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TnikP83510 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TnikP83510 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TnikP83510 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TnikP83510 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TnikP83510 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TnikP83510 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TnikP83510 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TnikP83510 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
TnikP83510 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TnikP83510 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TnikP83510 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TnikP83510 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TnikP83510 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TnikP83510 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TnikP83510 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TnikP83510 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TnikP83510 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TnikP83510 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TnikP83510 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TnikP83510 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TnikP83510 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TnikP83510 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TnikP83510 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TnikP83510 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
TnikP83510 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TnikP83510 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TnikP83510 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TnikP83510 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TnikP83510 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TnikP83510 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TnikP83510 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TnikP83510 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TnikP83510 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TnikP83510 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TnikP83510 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TnikP83510 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TnikP83510 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TnikP83510 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TnikP83510 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TnikP83510 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TnikP83510 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TnikP83510 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TnikP83510 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TnikP83510 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TnikP83510 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TnikP83510 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TnikP83510 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TnikP83510 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TnikP83510 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TnikP83510 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TnikP83510 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TnikP83510 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TnikP83510 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TnikP83510 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TnikP83510 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TnikP83510 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TnikP83510 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TnikP83510 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TnikP83510 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TnikP83510 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TnikP83510 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TnikP83510 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TnikP83510 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TnikP83510 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TnikP83510 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TnikP83510 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TnikP83510 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TnikP83510 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TnikP83510 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TnikP83510 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TnikP83510 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TnikP83510 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TnikP83510 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TnikP83510 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TnikP83510 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
TnikP83510 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TnikP83510 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TnikP83510 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TnikP83510 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TnikP83510 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TnikP83510 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms