Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Irx3P81067 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Irx3P81067 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Irx3P81067 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Irx3P81067 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Irx3P81067 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx3P81067 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Irx3P81067 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Irx3P81067 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx3P81067 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx3P81067 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Irx3P81067 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx3P81067 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Irx3P81067 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Irx3P81067 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Irx3P81067 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Irx3P81067 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx3P81067 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Irx3P81067 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms