Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms