Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp8a1P70704 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp8a1P70704 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp8a1P70704 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp8a1P70704 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp8a1P70704 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp8a1P70704 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms