Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr1bP70700 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr1bP70700 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Polr1bP70700 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr1bP70700 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr1bP70700 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms