Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frat1P70339 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Frat1P70339 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Frat1P70339 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Frat1P70339 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Frat1P70339 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frat1P70339 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frat1P70339 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Frat1P70339 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Frat1P70339 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Frat1P70339 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frat1P70339 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Frat1P70339 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms