Protein–RNA interactions for Protein: P63158

Hmgb1, High mobility group protein B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgb1P63158 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hmgb1P63158 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hmgb1P63158 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Hmgb1P63158 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Hmgb1P63158 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hmgb1P63158 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hmgb1P63158 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hmgb1P63158 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms