Protein–RNA interactions for Protein: P61963

Dcaf7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf7P61963 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dcaf7P61963 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dcaf7P61963 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dcaf7P61963 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dcaf7P61963 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dcaf7P61963 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dcaf7P61963 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dcaf7P61963 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dcaf7P61963 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms