Protein–RNA interactions for Protein: P61148

Fgf1, Fibroblast growth factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf1P61148 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fgf1P61148 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fgf1P61148 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgf1P61148 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgf1P61148 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgf1P61148 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgf1P61148 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgf1P61148 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms