Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CgnP59242 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CgnP59242 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CgnP59242 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CgnP59242 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CgnP59242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CgnP59242 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CgnP59242 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CgnP59242 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CgnP59242 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CgnP59242 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CgnP59242 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CgnP59242 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CgnP59242 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CgnP59242 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CgnP59242 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CgnP59242 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CgnP59242 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CgnP59242 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CgnP59242 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CgnP59242 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CgnP59242 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CgnP59242 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CgnP59242 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CgnP59242 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CgnP59242 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CgnP59242 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CgnP59242 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CgnP59242 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CgnP59242 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CgnP59242 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CgnP59242 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CgnP59242 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CgnP59242 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CgnP59242 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CgnP59242 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CgnP59242 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CgnP59242 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CgnP59242 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CgnP59242 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CgnP59242 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CgnP59242 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CgnP59242 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CgnP59242 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CgnP59242 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CgnP59242 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CgnP59242 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CgnP59242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CgnP59242 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CgnP59242 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CgnP59242 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CgnP59242 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CgnP59242 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CgnP59242 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CgnP59242 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CgnP59242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CgnP59242 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CgnP59242 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CgnP59242 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CgnP59242 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CgnP59242 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CgnP59242 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CgnP59242 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CgnP59242 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CgnP59242 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CgnP59242 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CgnP59242 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CgnP59242 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CgnP59242 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CgnP59242 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CgnP59242 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CgnP59242 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CgnP59242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CgnP59242 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CgnP59242 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CgnP59242 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CgnP59242 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CgnP59242 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CgnP59242 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CgnP59242 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CgnP59242 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CgnP59242 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CgnP59242 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CgnP59242 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CgnP59242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CgnP59242 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CgnP59242 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CgnP59242 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CgnP59242 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CgnP59242 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms