Protein–RNA interactions for Protein: P58854

Tubgcp3, Gamma-tubulin complex component 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp3P58854 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp3P58854 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tubgcp3P58854 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tubgcp3P58854 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tubgcp3P58854 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tubgcp3P58854 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tubgcp3P58854 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tubgcp3P58854 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms