Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P58686 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P58686 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P58686 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
P58686 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P58686 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P58686 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P58686 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P58686 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P58686 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P58686 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P58686 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P58686 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P58686 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P58686 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P58686 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P58686 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P58686 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P58686 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P58686 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P58686 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P58686 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P58686 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P58686 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P58686 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P58686 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P58686 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P58686 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P58686 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P58686 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P58686 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P58686 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P58686 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P58686 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P58686 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P58686 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P58686 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P58686 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P58686 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P58686 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P58686 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P58686 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P58686 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P58686 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P58686 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P58686 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P58686 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P58686 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P58686 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P58686 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P58686 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P58686 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P58686 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P58686 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P58686 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P58686 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P58686 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P58686 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P58686 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P58686 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P58686 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P58686 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P58686 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P58686 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P58686 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P58686 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P58686 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P58686 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P58686 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P58686 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P58686 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P58686 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P58686 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P58686 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
P58686 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P58686 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
P58686 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P58686 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P58686 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P58686 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P58686 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P58686 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
P58686 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms