Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcbp4P57724 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcbp4P57724 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcbp4P57724 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcbp4P57724 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcbp4P57724 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp4P57724 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms