Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp5P56399 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp5P56399 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp5P56399 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp5P56399 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp5P56399 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp5P56399 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp5P56399 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp5P56399 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp5P56399 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp5P56399 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp5P56399 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp5P56399 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp5P56399 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp5P56399 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp5P56399 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp5P56399 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp5P56399 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp5P56399 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms