Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox17P56394 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox17P56394 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cox17P56394 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox17P56394 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox17P56394 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cox17P56394 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox17P56394 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox17P56394 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cox17P56394 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox17P56394 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox17P56394 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms