Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdkn2bP55271 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdkn2bP55271 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdkn2bP55271 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdkn2bP55271 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdkn2bP55271 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdkn2bP55271 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms