Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CnbpP53996 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CnbpP53996 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CnbpP53996 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CnbpP53996 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CnbpP53996 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CnbpP53996 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CnbpP53996 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CnbpP53996 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CnbpP53996 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CnbpP53996 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CnbpP53996 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CnbpP53996 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CnbpP53996 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CnbpP53996 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms