Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efnb1P52795 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efnb1P52795 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efnb1P52795 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efnb1P52795 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efnb1P52795 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Efnb1P52795 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efnb1P52795 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efnb1P52795 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efnb1P52795 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efnb1P52795 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Efnb1P52795 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Efnb1P52795 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Efnb1P52795 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms