Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XpcP51612 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XpcP51612 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
XpcP51612 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
XpcP51612 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
XpcP51612 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
XpcP51612 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XpcP51612 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XpcP51612 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
XpcP51612 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
XpcP51612 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
XpcP51612 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XpcP51612 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
XpcP51612 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
XpcP51612 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
XpcP51612 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XpcP51612 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
XpcP51612 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
XpcP51612 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XpcP51612 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
XpcP51612 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XpcP51612 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XpcP51612 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XpcP51612 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XpcP51612 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XpcP51612 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XpcP51612 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XpcP51612 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
XpcP51612 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XpcP51612 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XpcP51612 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XpcP51612 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XpcP51612 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XpcP51612 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XpcP51612 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
XpcP51612 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
XpcP51612 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XpcP51612 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XpcP51612 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XpcP51612 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XpcP51612 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
XpcP51612 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
XpcP51612 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XpcP51612 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
XpcP51612 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
XpcP51612 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
XpcP51612 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
XpcP51612 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
XpcP51612 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XpcP51612 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
XpcP51612 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
XpcP51612 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
XpcP51612 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XpcP51612 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XpcP51612 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
XpcP51612 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XpcP51612 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
XpcP51612 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XpcP51612 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
XpcP51612 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XpcP51612 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
XpcP51612 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
XpcP51612 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
XpcP51612 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XpcP51612 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XpcP51612 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
XpcP51612 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XpcP51612 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
XpcP51612 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XpcP51612 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
XpcP51612 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
XpcP51612 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
XpcP51612 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
XpcP51612 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XpcP51612 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
XpcP51612 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XpcP51612 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XpcP51612 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
XpcP51612 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XpcP51612 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XpcP51612 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XpcP51612 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
XpcP51612 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
XpcP51612 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XpcP51612 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XpcP51612 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms