Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Opn1swP51491 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Opn1swP51491 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Opn1swP51491 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Opn1swP51491 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Opn1swP51491 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Opn1swP51491 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms