Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LtbrP50284 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LtbrP50284 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LtbrP50284 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LtbrP50284 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LtbrP50284 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LtbrP50284 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LtbrP50284 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtbrP50284 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtbrP50284 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LtbrP50284 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LtbrP50284 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LtbrP50284 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LtbrP50284 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms