Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Brca1P48754 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Brca1P48754 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Brca1P48754 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brca1P48754 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brca1P48754 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brca1P48754 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brca1P48754 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brca1P48754 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brca1P48754 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Brca1P48754 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Brca1P48754 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms