Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpl13P47963 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rpl13P47963 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rpl13P47963 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rpl13P47963 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rpl13P47963 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rpl13P47963 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms