Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TesP47226 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TesP47226 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TesP47226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TesP47226 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TesP47226 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TesP47226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TesP47226 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TesP47226 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TesP47226 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TesP47226 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TesP47226 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TesP47226 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TesP47226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TesP47226 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TesP47226 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TesP47226 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TesP47226 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TesP47226 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TesP47226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TesP47226 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TesP47226 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TesP47226 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TesP47226 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TesP47226 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TesP47226 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TesP47226 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TesP47226 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TesP47226 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TesP47226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TesP47226 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TesP47226 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TesP47226 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TesP47226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TesP47226 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TesP47226 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TesP47226 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TesP47226 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TesP47226 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TesP47226 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TesP47226 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TesP47226 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TesP47226 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TesP47226 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TesP47226 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TesP47226 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TesP47226 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TesP47226 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TesP47226 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TesP47226 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TesP47226 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TesP47226 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TesP47226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TesP47226 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TesP47226 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TesP47226 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TesP47226 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TesP47226 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TesP47226 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TesP47226 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TesP47226 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TesP47226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TesP47226 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TesP47226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TesP47226 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TesP47226 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TesP47226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TesP47226 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TesP47226 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TesP47226 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TesP47226 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TesP47226 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TesP47226 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TesP47226 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TesP47226 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TesP47226 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TesP47226 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TesP47226 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TesP47226 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TesP47226 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TesP47226 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TesP47226 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TesP47226 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TesP47226 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TesP47226 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TesP47226 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TesP47226 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TesP47226 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TesP47226 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TesP47226 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TesP47226 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TesP47226 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TesP47226 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TesP47226 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TesP47226 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms