Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sdc2P43407 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdc2P43407 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sdc2P43407 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sdc2P43407 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sdc2P43407 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sdc2P43407 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms