Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pik3caP42337 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pik3caP42337 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pik3caP42337 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pik3caP42337 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pik3caP42337 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pik3caP42337 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pik3caP42337 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pik3caP42337 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms