Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tac1P41539 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tac1P41539 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tac1P41539 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tac1P41539 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tac1P41539 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tac1P41539 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tac1P41539 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tac1P41539 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tac1P41539 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tac1P41539 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tac1P41539 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tac1P41539 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tac1P41539 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tac1P41539 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tac1P41539 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tac1P41539 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tac1P41539 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tac1P41539 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms